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基于分子生物学的相关技术

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生物大分子,特别是蛋白质和核酸结构功能的研究,是分子生物学的基础。目前生物医药领域的研究越来越深入,先导医药药效平台配备了分子生物学研究的很多先进设备,可为客户提供核酸(包括核酸提取纯化、FISH、定量PCR、载体构建等)与蛋白(包括Western Blot、双向电泳,酶联免疫分析等)研究的多种技术服务。

 

服务内容

核酸提取与纯化技术

荧光原位杂交(FISH)

SNPs分析

普通PCR、荧光定量PCR(标准PCR实验室)

蛋白质免疫印迹(Western Blot)

双向电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)

双荧光素酶报告基因

载体构建

RNA干扰

酶联免疫分析法

免疫沉淀

免疫共沉淀

凝胶迁移实验

 

 

 

核酸提取与纯化技术

 

 

 

 

荧光原位杂交(FISH)

荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization FISH)广泛应用于动植物基因组结构研究、染色体精细结构变异分析、病毒感染分析、人类产前诊断、肿瘤遗传学和基因组进化研究待许多领域。

FISH的基本原理是用已知的标记单链核酸为探针,按照碱基互补的原则,与待检材料中未知的单链核酸进行异性结合,形成可被检测的杂交双链核酸。由于DNA分子在染色体上是沿着染色体纵轴呈线性排列,因而可以探针直接与染色体进行杂交从而将特定的基因在染色体上定位。与传统的放射性标记原位杂交相比,荧光原位杂交具有快速、检测信号强、杂交特异性高和可以多重染色等特点。

 

 

 

SNPs分析

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。

SNP作为具有已知性、可遗传性、可检测性的第三代遗传标记,可用于疾病基因的定位、克隆和鉴定。

 

 

 

普通PCR、荧光定量PCR(标准PCR实验室)

聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,能将微量的DNA大幅增加。PCR广泛应用于基因检测,具有高度敏感性、特异性、快速、简单等特点,能将传统方法难以检测的DNA片段扩增百万倍以上,从而提高疾病的诊断水平。它不仅可用于基因分离、克隆和核酸序列分析等基础研究,还可用于疾病的诊断或任何有DNA,RNA的地方。

先导建立有标准PCR实验室。标准PCR扩增检验实验室原则上分为三个单独的工作区域:试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增和扩增产物分析区。各区域完全独立分隔,严格划分工作区域,设置符合规范要求的空调通风系统,配备完善的实验室设施,从源头预防污染。

 

先导医疗

 

 

 

 

载体构建

载体构建(vectorconstruction),为把DNA分子运送到受体细胞中去,必须寻找一种能进入细胞、在装载了外来的DNA片段后仍能照样复制的运载体。理想的运载体是质粒(plasmid),在基因工程中,常用人工构建的质粒作为载体。载体构建即是构建含外源DNA的质粒。载体构建是分子生物学研究常用的手段之一。主要包括已有载体多克隆位点MCS的改造和已有载体启动子、增强子、筛选标记等功能元件的改造。载体构建完成后可利用PCR原理进行测序验证。

 

 

 

RNA干扰

RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。基因沉默,主要有转录前水平的基因沉默(TGS)和转录后水平的基因沉默(PTGS)两类:TGS是指由于DNA修饰或染色体异染色质化等原因使基因不能正常转录;PTGS是启动了细胞质内靶mRNA序列特异性的降解机制。有时转基因会同时导致TGS和PTGS。

使用RNA技术可以特异性剔除或关闭特定基因的表达,所以该技术已被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的基因治疗领域。

 

 

 

蛋白质免疫印迹(Western Blot)

免疫印迹(immunoblotting)又称蛋白质印迹(Western blotting),是根据抗原抗体的特异性结合检测复杂样品中的某种蛋白的方法。该法是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的一种新的免疫生化技术。由于免疫印迹具有 SDS-PAGE 的高分辨力和固相免疫测定的高特异性和敏感性,是蛋白分析的一种常规技术。免疫印迹常用于鉴定某种蛋白,并能对蛋白进行定性和半定量分析。结合化学发光检测,可以同时比较多个样品同种蛋白的表达量差异。蛋白质印迹印迹有如下优点:

湿的固定化基质膜柔韧, 易于操作;

· 固定化的生物大分子可均一的与各种免疫探针接近, 不会象凝胶那样受孔径阻隔;

· 免疫印迹分析只需少量试剂

· 孵育、洗涤的时间明显减短

· 可同时制作多个拷贝, 用于多种分析和鉴定

· 结果以图谱形式可长期保存

 

Western blotting

先导医疗

 

 

 

双向电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)

双向电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)是等电聚焦电泳和SDS-PAGE的组合,即先进行等电聚焦电泳(按照pI分离),然后再进行SDS-PAGE(按照分子大小),经染色得到的电泳图是个二维分布的蛋白质图。

 

 

 

双荧光素酶报告基因

荧光素酶(Luciferase)是生物体内催化荧光素(luciferin)或脂肪醛(firefly aldehyde)氧化发光的一类酶的总称,来自于自然界能够发光的生物。目前,以北美萤火虫虫(Photinus pyralis)来源的荧光素酶基因应用的最为广泛,该基因可编码550个氨基酸的荧光素酶蛋白,是一个61kDa的单体酶,无需表达后修饰,直接具有完全酶活。生物荧光实质是一种化学荧光。萤火虫荧光素酶在Mg2+、ATP、O2的参与下,催化D2荧光素(D2luciferin) 氧化脱羧,产生激活态的氧化荧光素,并放出光子,产生550~580 nm 的荧光。荧光素酶是靠酶和底物的相互反应发光,特异性很强,灵敏度高,由于没有激发光的非特异性干扰,信噪比也比较高。荧光素酶报告基因具有灵敏度高、内源性低、哺乳动物无内源性表达、不受细胞内其他物质影响、发光检测,检测方便、灵敏度高、检测范围广等优点。

 

 

 

酶联免疫分析法

酶联免疫吸附试验是一种固相免疫测定技术,其先将抗体或抗原包被到某种固相载体表面,并保持其免疫活性。测定时,将待检样本和酶标抗原或抗体按不同步骤与固相载体表面吸附的抗体或抗原发生反应,后加入酶标抗体与免疫复合物结合,用洗涤的方法分离抗原抗体复合物和游离的未结合成分,最后加入酶反应底物,根据底物被酶催化产生的颜色及其吸光度(A)值的大小进行定性或定量分析的法。根据检测目的和操作步骤不同,有双抗体夹心法、间接法、竞争法三种类型的常用方法。

 

 

 

免疫沉淀

免疫沉淀是利用抗体特异性反应纯化富集目的蛋白的一种方法。抗体与细胞裂解液或表达上清中相应的蛋白结合后,再与蛋白A/G(ProteinA/G)或二抗偶联的agarose或Sepharose珠子孵育,通过离心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗体-目的蛋白复合物,沉淀经过洗涤后,重悬于电泳上样缓冲液,煮沸5-10min,在高温及还原剂的作用下,抗原与抗体解离,离心收集上清,上清中包括抗体、目的蛋白和少量的杂蛋白。

 

 

 

免疫共沉淀

免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。 当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。当用预先固化在argarose beads上的蛋白质A的抗体免疫沉淀A蛋白,那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。再通过蛋白变性分离,对B蛋白进行检测,进而证明两者间的相互作用 。

 

 

 

凝胶迁移实验

胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。

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